TAMRA azide, 5- isomer
目录号 : GC12594
TAMRA azide, 5- isomer是一种含叠氮基团的荧光探针，具有特定光谱特性（激发波长562/40nm，发射波长624/40nm）。
Cas No.:825651-66-9
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
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TAMRA azide, 5- isomer is a fluorescent probe that contains an azide group, with the spectral characteristics (excitation 562/40nm, emission 624/40nm)[1]. TAMRA azide, 5-isomer is highly suitable for different click reactions or the Staudinger ligation, and reacting with alkyne, DBCO and BCN[2].
TAMRA azide was used as a fluorophore to label histone H3 and allowed efficient labeling of the modified substrate by CuAAC click chemistry[3]. TAMRA azide has been used for protein microarray immobilization to develop protein biosensors[2]. In HEK293T cells, TAMRA azide has been used in click chemistry to detect S-palmitoylation[4].
References:
[1] Tercel M, McManaway S P, Liyanage H D S, et al. Preparation and properties of clickable amino analogues of the duocarmycins: factors that affect the efficiency of their fluorescent labelling of DNA[J]. ChemMedChem, 2014, 9(9): 2193-2206.
[2] Dadfar S M M, Sekula‐Neuner S, Trouillet V, et al. Protein Microarray Immobilization via Epoxide Ring‐Opening by Thiol, Amine, and Azide[J]. Advanced Materials Interfaces, 2021, 8(10): 2002117.
[3] Willnow S, Martin M, Lüscher B, et al. A selenium‐based click AdoMet analogue for versatile substrate labeling with wild‐type protein methyltransferases[J]. ChemBioChem, 2012, 13(8): 1167-1173.
[4] Yu T, Hou D, Zhao J, et al. NLRP3 Cys126 palmitoylation by ZDHHC7 promotes inflammasome activation[J]. Cell reports, 2024, 43(4).
TAMRA azide, 5- isomer是一种含叠氮基团的荧光探针，具有特定光谱特性（激发波长562/40nm，发射波长624/40nm）[1]。TAMRA azide, 5- isomer非常适用于点击化学反应或施陶丁格连接反应，能与炔烃、DBCO及BCN发生反应[2]。
TAMRA azide可作为组蛋白H3的荧光标记物，通过铜催化叠氮-炔环加成反应（CuAAC）实现修饰底物的高效标记[3]。TAMRA azide已成功应用于蛋白质微阵列固定化技术，以开发蛋白质生物传感器[2]。在HEK293T细胞体系中，TAMRA azide可通过点击化学反应实现S-棕榈酰化修饰的检测[4]。
TAMRA azide可通过点击化学反应用于炔烃标记物Alk14（炔14）的信号检测：
转染质粒并用50μM Alk14处理HEK293T细胞6小时后，分别使用抗Flag M2树脂和GFP-Trap对Flag-NLRP3及NLRP3-GFP进行免疫共沉淀。
琼脂糖珠经免疫沉淀洗涤缓冲液清洗三次后，重悬于20μL相同缓冲液中。
向珠悬液中加入点击化学反应混合试剂（含2mM TAMRA azide、10mM TBTA、40mM CuSO4、40mM TCEP，各组分1μL），避光室温孵育。
30分钟后加入10μL SDS上样缓冲液终止反应，95℃煮沸10分钟。
煮沸后的样品离心取上清，转移至新管中进行羟胺处理（终浓度0.5M），再次煮沸5分钟。
最后通过SDS-PAGE电泳和ChemiDoc成像系统进行凝胶内荧光分析，检测Alk14标记信号。
Reference:
[1] Yu T, Hou D, Zhao J, et al. NLRP3 Cys126 palmitoylation by ZDHHC7 promotes inflammasome activation[J]. Cell reports, 2024, 43(4).
| Cas No. | 825651-66-9 | SDF | |
| 化学名 | N-(3-azidopropyl)-3',6'-bis(dimethylamino)-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-5-carboxamide | ||
| Canonical SMILES | CN(C)C1=CC2=C(C=C1)C3(C4=C(C=C(C=C4)C(=O)NCCCN=[N+]=[N-])C(=O)O3)C5=C(O2)C=C(C=C5)N(C)C | ||
| 分子式 | C28H28N6O4 | 分子量 | 512.56 |
| 溶解度 | DMSO : 125 mg/mL (243.87 mM; Need ultrasonic) | 储存条件 | -20°C,protect from light. |
| General tips | 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液；一旦配成溶液，请分装保存，避免反复冻融造成的产品失效。 储备液的保存方式和期限：-80°C 储存时，请在 6 个月内使用，-20°C 储存时，请在 1 个月内使用。 为了提高溶解度，请将管子加热至37℃，然后在超声波浴中震荡一段时间。 |
||
| Shipping Condition | 评估样品解决方案：配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸：配备RT，或根据请求配备蓝冰。 | ||
| 制备储备液 | |||
 |
1 mg | 5 mg | 10 mg |
| 1 mM | 1.951 mL | 9.755 mL | 19.5099 mL |
| 5 mM | 0.3902 mL | 1.951 mL | 3.902 mL |
| 10 mM | 0.1951 mL | 0.9755 mL | 1.951 mL |
| 第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量） | ||||||||||
| 给药剂量 | mg/kg |  |
动物平均体重 | g | |
每只动物给药体积 | ul | |
动物数量 | 只 |
| 第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶于水的药物；不同批次药物配方比例不同，请联系GLPBIO为您提供正确的澄清溶液配方） | ||||||||||
| % DMSO % % Tween 80 % saline | ||||||||||
| 计算重置 | ||||||||||
计算结果:
工作液浓度： mg/ml；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL，
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL saline，混匀澄清。
1. 首先保证母液是澄清的；
2.
一定要按照顺序依次将溶剂加入，进行下一步操作之前必须保证上一步操作得到的是澄清的溶液，可采用涡旋、超声或水浴加热等物理方法助溶。
3. 以上所有助溶剂都可在 GlpBio 网站选购。
Quality Control & SDS
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