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Epigenetic Reader Domain(表观识别蛋白结构域)

Epigenetic regulators of gene expression and chromatin state include so-called writers, erasers, and readers of chromatin modifications.Well-characterized examples of reader domains include bromodomains typically binding acetyllysine and chromatin organization modifier (chromo), malignant brain tumor (MBT), plant homeodomain (PHD), and Tudor domains generally associating with methyllysine. Research on epigenetic readers has been tremendously influenced by the discovery of selective inhibitors targeting the bromodomain and extraterminal motif (BET) family of acetyl-lysine readers. The human genome encodes 46 proteins containing 61 bromodomains clustered into eight families. Distinct experimental approaches are used to identify the first BET inhibitors, GSK 525762A and (+)-JQ-1.

The Polycomb group (PcG) protein, enhancer of zeste homologue 2 (EZH2), has an essential role in promoting histone H3 lysine 27 trimethylation (H3K27me3) and epigenetic gene silencing. This function of EZH2 is important for cell proliferation and inhibition of cell differentiation, and is implicated in cancer progression. Cyclin-dependent kinases regulate epigenetic gene silencing through phosphorylation of EZH2. In many types of cancers including lymphomas and leukemia, EZH2 is postulated to exert its oncogenic effects via aberrant histone and DNA methylation, causing silencing of tumor suppressor genes.

p300/CBP is not only a transcriptional adaptor but also a histone acetyltransferase.

Products for  Epigenetic Reader Domain

  1. Cat.No. 产品名称 Information
  2. GC70037 TMX1 TMX1 是一种 BRD4 共价分子胶降解剂。TMX1 选择性地将 DCAF16 招募到 BRD4BD2 上，导致 BRD4 的降解。
  3. GC69601 OARV-771 OARV-771 是一种基于 VHL 的 BET 降解剂 (PROTAC)，具有改善的细胞通透性。OARV-771 显示 Brd4、Brd2 和 Brd3 的 DC50 分别为 6、1 和 4 nM。
  4. GC69456 MI-2-2 MI-2-2 是一种有效的 menin-MLL 抑制剂。MI-2-2 以低纳摩尔亲和力 (Kd=22 nM) 与 menin 结合，并非常有效地破坏 menin 和 MLL 之间的二价蛋白质-蛋白质相互作用。MI-2-2 在 MLL 白血病细胞中具有特异且非常显著的活性，包括抑制细胞增殖、下调 Hoxa9 表达和分化。
  5. GC69197 GSK761 GSK761 是 Sp 140 核体蛋白 (SP140) 的选择性抑制剂，IC50 值为 77.79 nM。GSK761 减少了单核细胞向炎性巨噬细胞的分化和脂多糖 (LPS) 诱导的炎症激活。GSK761 通过抑制 SP140 诱导了 CD206+ 调节巨噬细胞的产生。
  6. GC69108 FHD-609 FHD-609 是含溴结构域蛋白 BRD9 的抑制剂和降解剂。FHD-609 靶向 ncBAF，可用于研究包含 BAF 复合亚基突变的多种癌症。FHD-609 联合 Telomelysin 或 INO5401，可能在对肾上腺皮质癌 (ACC) 研究中发挥作用。
  7. GC68994 DN02 DN02 是一种有效的选择性 BRD8 溴域探针。DN02 对 BRD8 (1) (Ki=32 nM) 具有较高的亲和力, 其亲和力是BRD8 (2) 的 30 倍 (Ki＞1000 nM)。
  8. GC68948 DC-BPi-11 hydrochloride DC-BPi-11 hydrochloride 是溴域 PHD 指转录因子 (BPTF) 的抑制剂，IC50 为 698 nM。DC-BPi-11 hydrochloride 对白血病细胞增殖有显著抑制作用。
  9. GC68803 BRD4 Inhibitor-20 BRD4 Inhibitor-20 是一种有效的溴结构域蛋白 4 (BRD4) 抑制剂，具有口服活性。 BRD4 Inhibitor-20 对 BRD4 (BD1) 和BRD4 (BD2) 具有抑制活性，IC50 值分别为 19 nM 和 28 nM。 BRD4 Inhibitor-20 在癌细胞系中也具有抗增殖活性。 BRD4 Inhibitor-20 可用于结肠癌等多种癌症的研究。
  10. GC68711 AZ13824374 AZ13824374 是一种高效的选择性 ATAD2 抑制剂，对乳腺癌据抗增殖活性。AZ13824374 在 ATAD2 FRET 和 ATAD2 NanoBRET 检测中对 ATAD2 的 pIC50 分别为 8.2 和 6.2。
  11. GC68439 GNE-064 GNE-064 (compound 5) 是一种选择性的，具有口服活性的以及高可溶性的 SMARCA4，SMARCA2 和 PBRM1 bromodomains 5 抑制剂。GNE-064 对 SMARCA4 具有抑制作用，其 IC50 值为 0.035 μM，对 SMARCA2 也具有抑制作用，其 EC50 值为 0.10 μM。GNE-064 对 SMARCA4，SMARCA2，PBRM1 bromodomains 5 和 PBRM1 bromodomains 2 的 Kd 值为 0.01，0.016，0.018 以及 0.049 μM。GNE-064 可以作为一种药物探针，用于药物合成的研究。
  12. GC68025 UNC1021 UNC1021 是一种选择性的 L3MBTL3 抑制剂，IC50 为 0.048 μM。
  13. GC67912 Amredobresib Amredobresib 是一种有效的 BET 抑制剂。Amredobresib 抑制溴结构域与组蛋白 H3 和 H4 上乙酰化赖氨酸的结合，因此充当基因转录的重要调节剂。Amredobresib 可用于研究急性髓性白血病 (AML) 和癌症 (信息摘自专利 WO2019145410A1 和 WO2021175824A1)。
  14. GC66441 BRD4/CK2-IN-1 BRD4/CK2-IN-1 是一种首次高效、口服有效的 BRD4/CK2 (含溴结构域蛋白 4/酪蛋白激酶 2) 双靶点抑制剂。BRD4/CK2-IN-1 对 BRD4 和 CK2 的 IC50 值分别为 180 nM 和 230 nM。BRD4/CK2-IN-1具有很强的抗癌活性，且无明显毒性。BRD4/CK2-IN-1 在三阴性乳腺癌 (TNBC) 中诱导细胞凋亡和自噬相关的细胞死亡。
  15. GC66067 ODM-207 ODM-207 is a potent and selective BET inhibitor that is structurally unrelated to the benzodiazepine. ODM-207 also shows potent antiproliferative effects in patient-derived cancer cells and in xenograft models.
  16. GC65602 CFT8634 CFT8634 is a degrader targeting BRD9 extracted from patent WO2021178920A1 compound 173, which can be used for the research of synovial sarcoma and SMARCB1-deleted solid tumors.
  17. GC65574 SNIPER(BRD)-1 SNIPER(BRD)-1 由 IAP 拮抗剂 LCL-161 衍生物和 BET 抑制剂 (+)-JQ-1，通过 linker 连接组成。SNIPER(BRD)-1 通过泛素-蛋白酶体系统诱导 BRD4 降解。SNIPER(BRD)-1 也降解 cIAP1，cIAP2 和 XIAP，IC50 分别为 6.8 nM，17 nM 和 49 nM。
  18. GC65569 BRD4 Inhibitor-24 BRD4 Inhibitor-24 (compound 3U) 是一种有效的 BRD4 抑制剂，BRD4 Inhibitor-24 对 MCF7 和 K652 细胞表现出抗肿瘤活性，IC50 分别为 33.7 和 45.9 μM (来自专利 CN107721975A)。
  19. GC65506 BETd-246 BETd-246 是第二代、基于 PROTAC 技术的、 BET溴端结构域 (BRD) 的抑制剂，由Cereblon配体和BET配体相连，具有良好的选择性、有效性和抗肿瘤活性。
  20. GC65326 GNE-375 GNE-375 是一种有效且高度选择性的 BRD9 抑制剂，IC50 为 5 nM。GNE-375 对 BRD9 的选择性比 BRD4、TAF1 和 CECR2 高 100 倍以上。GNE-375 降低 BRD9 与染色质的结合。
  21. GC65269 ZXH-3-26 ZXH-3-26 是由Cereblon配体和BRD4配体相连的PROTAC，处理 5 小时后，DC50 约为 5 nM。
  22. GC65204 ZL0454 ZL0454是有效，选择性的含有溴结构域的蛋白质4 (BRD4)抑制剂，对BD1和BD2的IC50分别为49和32 nM 。
  23. GC65160 FHT-1015 FHT-1205 是一种有效的 SMARCA4/SMARCA2 ATPase (BRG1 和 BRM) 抑制剂，IC50 ≤10 nM (WO2020160180A1；化合物 67)。
  24. GC65135 VZ185 VZ185 是高效，快速，选择性的基于von Hippel-Lindau的BRD9和BRD7双降解探针，DC50 分别为 4.5 和 1.8 nM。VZ185对 EOL-1 和 A-402 细胞具有细胞毒性，EC50 分别为 3nM 和 40nM。
  25. GC64999 MS402 MS402 是一种 BD1 选择性的 BET BrD 抑制剂，对 BRD4(BD1)，BRD4(BD2)，BRD3(BD1)， BRD3(BD2)， BRD2(BD1) 和 BRD2(BD2) 的 Ki 分别为 77 nM，718 nM，110 nM，200 nM，83 nM 和 240 nM。MS402 阻断 Th17 细胞分化并改善小鼠结肠炎。
  26. GC64960 BRD4 Inhibitor-10 BI 894999 is a potent and selective BET inhibitor with IC50 of 5 nM and 41 nM for the binding of BRD4-BD1 and BRD4-BD2 to acetylated histones, respectively. BI 894999 is highly selective for BRD2/3/4 and BRDT (Kd of 0.49-1.6?nM), with at least a 200-fold selectivity vs. BRD4-BD1.
  27. GC64821 FHD-286 FHD-286 is a BRG1/BRM ATPase inhibitor for the treatment of BAF-related disorders such as acute myeloid leukemia.
  28. GC64789 Biotinylated-JQ1 Biotinylated-JQ1 (Biotin-JQ1) 是 JQ1 的生物素化衍生物，可高亲和力结合到 BRD4 溴区。Biotinylated-JQ1 抑制 MM1.S 多发性骨髓瘤细胞增殖，EC50 为 0.4 μM。
  29. GC64777 FHT-1204 FHT-1204 是一种有效的 SMARCA4/SMARCA2 ATPase (BRG1 和 BRM) 抑制剂，IC50 ≤10 nM (WO2020160180A1；化合物 70)。
  30. GC64696 CBP/p300-IN-12 CBP/p300-IN-12 是一种有效的选择性共价组蛋白乙酰转移酶 p300 (IC50 为 166 nM) 和 CBP 抑制剂。CBP/p300-IN-12 降低 PC-3 细胞的 H3K27Ac 水平 (EC50 为 37 nM)。CBP/p300-IN-12 可与 C1450 形成共价加合物。
  31. GC64541 BRM/BRG1 ATP Inhibitor-2 BRM/BRG1 ATP Inhibitor-2 是一种 BRG1/BRM ATP 酶抑制剂，治疗 BAF 相关疾病。
  32. GC64538 BPTF-IN-BZ1 BPTF-IN-BZ1 是一种 BPTF 抑制剂，具有高效价（Kd = 6.3 nM）。
  33. GC64529 ZL0590 ZL0590 是一种有效的，具有口服活性 BRD4 BD1 选择性抑制剂，对人 BRD4 BD1的 IC50 为 90 nM。ZL0590 具有显著的抗炎活性。
  34. GC64518 Ziftomenib Ziftomenib (KO-539) 是一种 menin-MLL 相互作用的抑制剂，具有抗肿瘤活性 (WO2017161028A1, compound 151)。
  35. GC64297 I-BET567 I-BET567 是一种有效、具有口服活性 pan-BET 候选抑制剂，对 BRD4 BD1 和 BD2 的 pIC50s 分别为 6.9 和 7.2。I-BET567 已在肿瘤和炎症小鼠模型中已被证明有效。
  36. GC64271 AU-15330 AU-15330 is a proteolysis-targeting chimera (PROTAC) degrader of the SWI/SNF ATPase subunits, SMARCA2 and SMARCA4, which can induce potent inhibition of tumor growth in xenograft models of prostate cancer.
  37. GC64040 VTP50469 fumarate VTP50469 fumarate 是一种有效的，高选择性和口服活性的 Menin-MLL 相互作用抑制剂，Ki 为 104 pM。VTP50469 fumarate 具有高效的抗白血病活性。
  38. GC63887 SGC-SMARCA-BRDVIII SGC-SMARCA-BRDVIII is a potent and selective SMARCA2/4 BRD inhibitor.
  39. GC63791 (R)-(-)-JQ1 Enantiomer The inactive stereoisomer of a BET bromodomain inhibitor
  40. GC63694 BAZ1A-IN-1 BAZ1A-IN-1 is a potent inhibitor of BAZ1A (bromodomain-containing protein), exerting a Kd value of 0.52 μM against BAZ1A bromodomain, shows good anti-viability activity against cancer cell lines expressing a high level of BAZ1A, but weak or no activity against cancer cells with a low expression level of BAZ1A.
  41. GC63538 Menin-MLL inhibitor 20 Menin-MLL inhibitor 20 是一种不可逆的 menin-MLL 相互作用的抑制剂，具有抗肿瘤活性 (WO2020142557A1, compound 6)。
  42. GC63528 BET bromodomain inhibitor 1 BET bromodomain inhibitor 1 是一种具有口服活性的，选择性 BET 溴结构域抑制剂，对 BRD4 的 IC50 为 2.6 nM。BET bromodomain inhibitor 1 与 BRD2(2)，BRD3(2)，BRD4(1)，BRD4(2) 和 BRDT(2) 高亲和力结合 (Kd 值分别为 1.3 nM、1.0 nM、3.0 nM、1.6 nM、2.1 nM)。BET bromodomain inhibitor 1 具有抗癌活性。
  43. GC63178 RVX-297 RVX-297 是一种高效、具有口服活性、对 BD2 有选择性的 BET 抑制剂。RVX-297 对 BRD2(BD2)，BRD3(BD2)，BRD4(BD2) 的 IC50 分别为 0.08、0.05、0.02 μM。RVX-297 抑制多种免疫细胞炎症基因的表达。RVX-297 对临床前模型急性炎症和自身免疫的有效。
  44. GC63064 Menin-MLL inhibitor 19 Menin-MLL inhibitor 19，一种有效的 menin-mll 相互作用的抑制剂，例如 A17，源于专利 WO2019120209A1。Menin-MLL inhibitor 19 可用于多种疾病的研究，例如癌症、骨髓增生异常综合征 (MDS) 和糖尿病。
  45. GC62654 GSK778 GSK778 (iBET-BD1) is a strong BD1 bromodomain inhibitor of the BET proteins, with IC50 value of 75 nM for BRD2 BD1, 41 nM for BRD3 BD1, 41 nM for BRD4 BD1, and 143 nM for BRDT BD1.
  46. GC62620 NHWD-870 NHWD-870 inhibits CSF1 expression through suppressing BRD4 and its target HIF1α.
  47. GC62606 PROTAC BRD4 Degrader-8 PROTAC BRD4 Degrader-8 是一种有效的 BRD4 抑制剂，对 BRD4 BD1 和 BD2 的 IC50 值分别为 1.1 nM 和 1.4 nM。PROTAC BRD4 Degrader-8 能够有效降解 PC3 前列腺癌细胞中的 BRD4 蛋白。
  48. GC62591 LT052 LT052 是一种高选择性 BET BD1 抑制剂，其 IC50 为 87.7 nM。LT052 表现出纳摩尔级别的 BRD4 BD1 的抑制活性，选择性是 BRD4 BD2 的 138 倍 (IC50=12.130 μM)。LT052 具有抗炎活性，可用于急性痛风性关节炎研究。
  49. GC62405 UMB298 UMB298 是一种有效的选择性 CBP/P300 溴域抑制剂。
  50. GC62330 CC-90010 A BRD4 inhibitor
  51. GC62312 GSK620 GSK620 is a pan-BD2 inhibitor, which shows an anti-inflammatory phenotype in human whole blood with excellent broad selectivity, developability, and in vivo oral pharmacokinetics.

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