Biotin-16-UTP
目录号 : GB20150Biotin-16-UTP是一种生物素标记的UTP，用于体外转录制备RNA探针。
Cas No.:280549-77-1 (free acid)
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
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Biotin-16-UTP is a biotin-labeled UTP used for in vitro transcription to prepare RNA probes[1]. Biotin-16-UTP is an active substrate for RNA polymerase and can be incorporated by a variety of RNA polymerases (including SP6, T3, and T7 RNA polymerases) to form labeled RNA[2, 3]. Biotin-16-UTP-labeled RNA can be detected by reporter molecules linked to streptavidin, avidin, or anti-biotin antibodies[4, 5]. Biotin-16-UTP can be used for molecular hybridization and RNA-protein interaction studies[6].
References:
[1]McKenney K M, Connacher R P, Dunshee E B, et al. Chemi-Northern: a versatile chemiluminescent northern blot method for analysis and quantitation of RNA molecules[J]. RNA, 2024, 30(4): 448-462.
[2]Chien H, Alston C I, Dix R D. Suppressor of cytokine signaling 1 (SOCS1) and SOCS3 are stimulated within the eye during experimental murine cytomegalovirus retinitis in mice with retrovirus-induced immunosuppression[J]. Journal of Virology, 2018, 92(18): 10.1128/jvi. 00526-18.
[3]Chen M, Zhang L, Guo Y, et al. A novel lncRNA promotes myogenesis of bovine skeletal muscle satellite cells via PFN1‐RhoA/Rac1[J]. Journal of Cellular and Molecular Medicine, 2021, 25(13): 5988-6005.
[4]Ritchey B, Hai Q, Han J, et al. Genetic variant in 3’untranslated region of the mouse pycard gene regulates inflammasome activity[J]. Elife, 2021, 10: e68203.
[5]Bratthauer G L. The avidin–biotin complex (ABC) method and other avidin–biotin binding methods[J]. Immunocytochemical methods and protocols, 2010: 257-270.
[6]Siprashvili Z, Webster D E, Kretz M, et al. Identification of proteins binding coding and non-coding human RNAs using protein microarrays[J]. BMC genomics, 2012, 13: 1-13.
Biotin-16-UTP是一种生物素标记的UTP，用于体外转录制备RNA探针[1]。Biotin-16-UTP是RNA聚合酶的活性底物，能够通过多种RNA聚合酶（包括SP6、T3和T7 RNA聚合酶）掺入以形成标记的RNA[2, 3]。Biotin-16-UTP标记的RNA可以通过连接到链霉亲和素、亲和素或抗生物素抗体的报告分子来检测[4, 5]。Biotin-16-UTP能够用于分子杂交及RNA-蛋白相互作用研究[6]。
本方案仅提供一个指导，请根据您的具体需要进行修改。
1. 溶液配制
（1）储存液：本产品以10mM的储存液形式提供。
注意：未使用的储存液分装后在-20℃或-80°C避光保存，避免反复冻融。
（2）工作液：用实验缓冲液稀释储存液，通常配制成0.5mM的工作浓度。
注意：请根据实际情况调整工作液浓度，现用现配。
2. 用Biotin-16-UTP制备RNA探针[1](来自文献,仅做参考)
（1）模板DNA准备：在0.5mL试管中，将1μg纯化模板DNA或4μL对照DNA加入无菌、不含RNase的焦碳酸二乙酯（DEPC）水中，总样品体积为13μL。
（2）体外转录反应体系配制：对于每份样品，加入2μL 10×脱氧核苷三磷酸混合物、2μL 10×转录缓冲液、1μL Protector RNase抑制剂和2μL RNA聚合酶SP6或RNA聚合酶T7。
（3）标记反应：加入Biotin-16-UTP（终浓度通常为0.5mM），在37°C下孵育2h，制备RNA探针。
（4）终止反应：向每个管中加入2mL无RNase-free-DNase I以除去模板DNA，在37°C下孵育10min。向每个管中加入2mL 0.2M EDTA（pH 8.0）终止DNase I反应。
（5）分离RNA探针：通过氯化锂沉淀法分离RNA探针，并重悬于25μL DEPC水中。
References:
[1] Bharati B K, Swetha R K, Chatterji D. Identification and characterization of starvation induced msdgc-1 promoter involved in the c-di-GMP turnover[J]. Gene, 2013, 528(2): 99-108.
| Cas No. | 280549-77-1 (free acid) | SDF | Download SDF |
| 分子式 | C32H52N7O19P3S (free acid) | 分子量 | 963.8 (free acid) |
| 溶解度 | 储存条件 | Store at -20°C or below,always avoid freeze-thaw cycles and avoid direct sunlight. | |
| General tips | 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液；一旦配成溶液，请分装保存，避免反复冻融造成的产品失效。 储备液的保存方式和期限：-80°C 储存时，请在 6 个月内使用，-20°C 储存时，请在 1 个月内使用。 为了提高溶解度，请将管子加热至37℃，然后在超声波浴中震荡一段时间。 |
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| Shipping Condition | 评估样品解决方案：配备蓝冰进行发货。所有其他可用尺寸：配备RT，或根据请求配备蓝冰。 | ||
| 制备储备液 | |||
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1 mg | 5 mg | 10 mg |
| 1 mM | 1.0376 mL | 5.1878 mL | 10.3756 mL |
| 5 mM | 0.2075 mL | 1.0376 mL | 2.0751 mL |
| 10 mM | 0.1038 mL | 0.5188 mL | 1.0376 mL |
Quality Control & SDS
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- Purity: >99.00%
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